Gjeldende emnebeskrivelse (sist oppdatert 2019/20)
Akvagenomikk og bioinformatikk
BI311F
Gjeldende emnebeskrivelse (sist oppdatert 2019/20)

Akvagenomikk og bioinformatikk

BI311F
Emnet tar for seg grunnleggende dataprogrammering, analyse av DNA-sekvenser, sekvenssammenstillinger, annotering av genomer, konstruksjon av fylogenetiske trær, fylogenetisk footprinting, synteni-analyse, storskala ekspresjons- og epigenomisk-analyse, proteomikk og eksperimental genfunksjonsanalyse på genomnivå.
Studenten må være kvalifisert for Master i biovitenskap.
Studenten må være kvalifisert for Master i Marin økologi eller Master i havbruk.

Kunnskap og forståelse

Studenten skal

  • Ha en oversikt over de viktigste sidene ved komparativ og funskjonell genomikk
  • Mestre essensielle bioinformatiske konsepter og ha kjennskap til de riktige bioinformatiske verktøy
  • Ha kunnskap om relevante aspekter innen molekylærbiologi og biokjemi
  • Forstå hvordan genomforskning kan brukes til å løse aktuelle problemer innen akvakultur
  • Kjenne til prinsipper for dataanalyse av storskala funksjonell genomikk data

Ferdigheter

Studenten skal

  • Ha ferdighet innen databehandling og kunne bruke ulike bioinformatiske applikasjoner
  • Vite hvordan man analyserer store DNA-sekvenserte datasett
  • Være i stand til å undersøke og forutsi strukturen i eukaryote-gener
  • Være i stand til å undersøke evolusjonære relasjoner mellom gener og genomer fra ulike arter
  • Vite hvordan du henter data fra elektroniske databaser
  • Være i stand til å få tilgang og forstår vitenskapelig litteratur tilknyttet feltet

Generell kompetanse

Studenten skal

  • Forstå og anvende genomikk og bioinformatiske konsepter knyttet til "cutting edge" havbruksforskning
  • Kunne diskutere og presentere vitenskapelige artikler i genomikk og bioinformatikk
  • Har kompetanse til å delta på forskningsprosjekter innen i bioinformatikk og genomikk
Ingen kostnader utover semesteravgift og pensumlitteratur.
Valgemne:
Master i havbruk
Master i marin økologi
Forelesninger, veiledning og datalab.
Hvert semester foretas minst én muntlig midtevaluering (dialogmøte med referat) og en elektronisk sluttevaluering i henhold til høgskolens kvalitetssikringssystem. Tilbakemeldingene fra disse evalueringene legger grunnlaget for eventuelle endringer.

På bakgrunn av Covid-19 epidemien blir en rekke vurderinger og eksamener ved Nord universitet endret.

Endringer gjøres ih.h.t Midlertidig forskrift om tillegg til forskrift. 310.12019 nr 63 om studier og eksamener ved Nord universitet- Ekstraordinære tiltak som følge av koronaepidemien jmf § 2, Vurderingsformer ledd 1-3

For å imøtekomme dette, gjennomføres muntlig eksamen våren 2020 digitalt for dette emnet.

Evne til å gjøre utregninger, samt kunnskap om moldkylær biologi, biokjemi er en fordel.

Med overlapp menes en faglig likhet mellom emner med samme faginnhold. Du vil derfor få følgende reduksjon i studiepoeng om du har tatt emner som er angitt under:

BI311F-001 - Akvagenomikk og bioinformatikk - skoleeksamen - 5 Studiepoeng

BI311F-002 - Akvagenomikk og bioinformatikk - laboratoriearbeid - 3 Studiepoeng

BI311F-003 - Akvagenomikk og bioinformatikk - muntlig presentasjon - 2 Studiepoeng

BI311F-001 - Akvagenomikk og bioinformatikk - skoleeksamen - 10 Studiepoeng

BI311F-002 - Akvagenomikk og bioinformatikk - laboratoriearbeid - 10 Studiepoeng

BI311F-003 - Akvagenomikk og bioinformatikk - muntlig presentasjon - 10 Studiepoeng

BIO5017 - Akvagenomikk og bioinformatikk - 7.5 Studiepoeng

Velg kull
Pensumlitteratur
Leganto
Språk
Engelsk
Studiepoeng
10
Studiested
Bodø
Ansvarlig fakultet
Fakultet for biovitenskap og akvakultur
Emneansvarlig
Informasjon om emneansvarlig for valgt semester er ikke lenger tilgjengelig. Ta kontakt med nåværende emneansvarlig.