Disputas: Md. Golam Rbbani

Tittel på avhandlingen:

Characterization of Circular RNAs in Nile Tilapia Muscle and Thermal Modulation of their Expression in Relation to Growth

Tittel på prøveforelesning:

Gene-regulation in teleosts - with a focus on epigenetic and post-transcriptional events

Bedømmelseskomité:

• Førsteamanuensis Christian Kroun Damgaard, Aarhus Universitet, Danmark
• Førsteamanuensis Alessia Giannetto, University of Messina, Italia
• Førsteamanuensis Jens Mortansson Jelstrup Nolsøe, Nord universitet

Veiledere:

• Hovedveileder: Professor Jorge Manuel de Oliveira, Nord universitet
• Medveileder: Professor Artem Nedoluzhko, European University at St. Petersburg, Russland
• Medveileder: Professor Joost Andre M Raeymaekers, Nord universitet
• Medveileder: Forsker Jorge Galindo-Villegas, Nord universitet

Sammendrag av avhandlingen​:

Fiskemuskler er et sentralt punkt i akvakulturindustrien på grunn av deres kommersielle betydning som den spiselige delen av fisken. Utviklingen og veksten av musklene påvirkes intrikat av genetiske og miljømessige faktorer, inkludert temperatur. For øyeblikket forblir vår forståelse av de molekylære mekanismene som styrer disse prosessene ufullstendig. Derfor utforsker denne avhandlingen det komplekse regulatoriske nettverket av circular RNA-er (circRNAs) i muskelvekst hos fisk og undersøker forholdet mellom den termiske utviklingsplastisiteten til circRNA-uttrykk og muskelvekst.

For dette formålet benyttet vi en integrert omikkstilnærming, nøyaktig kvantifiserte og sammenlignet circRNA-, miRNA- og mRNA-uttrykksprofiler i den raske muskulaturen til Nil-tilapia, samtidig som vi manipulerte embryonale temperaturer for å forstå innflytelsen av circRNA-uttrykk på langsiktig vekst. Våre funn belyser den avgjørende rollen til circRNA-miRNA-mRNA-nettverk i å fremme muskelvekst. Videre observerte vi at circRNA-uttrykksmønstre varierer med embryonale temperaturer og korrelerer betydelig med vekststadiet i ungdomsalderen.

Denne avhandlingen representerer en betydelig fremgang i vår forståelse av circRNA-regulatoriske nettverk i muskelvekst hos Nil-tilapia. Den fremhever potensialet til circRNA-er som vekstrelaterte molekylære markører, og legger grunnlaget for å evaluere og overvåke fiskens respons på temperatursvingninger - en kritisk faktor i sammenheng med global klimaendring.